基因测序使得从癌症患者的活检中提取组织样本进行研究成为可能。分析样本中的基因可以了解它们之间的相互作用,并将它们与健康人的基因进行比较,以了解这种疾病及其异常情况。这种检测的结果被用来确定癌症的准确诊断,决定最有效的治疗计划,并监测病人对处方治疗的反应。
新一代测序(NGS)使肿瘤的表征成为可能,这导致:
(1)更好地了解不同癌症类型的生物学基础。
(2)定制疗法的发展。
(3)发现对药物反应和耐药性的基因组生物标记物。
(4)改善治疗癌症患者的医疗决定。
(5)癌症治疗的生物标志物检测,也称为基因组图谱或分子检测,使医生能够根据患者的基因组特征选择癌症治疗方法。
例如,受EGFR基因变化影响的癌症患者,可以被推荐精确针对这些变化的治疗方法——称为EGFR抑制剂的治疗方法。生物标志物检测的范围是确定影响患者的癌症是否显示出EGFR基因改变,可以用EGFR抑制剂治疗。
不同类型的生物标记物测试可以帮助选择不同的癌症治疗方法。有些测试是为了寻找某种生物标志物。另一些则是同时寻找几种生物标记物(多基因检测)。oncotype DX检测分析21个基因的活性,以评估化疗是否对患有乳腺癌的患者有效。
也有检测癌症中发生的基因变化数量(称为肿瘤突变负荷)的测试,以确定免疫检查点抑制剂是否可能对治疗一个人的癌症有效。
生物标记物检测并不能帮助所有人。测试可能不检测生物标志物适合一个可用的治疗,癌症的特点或病人的体质会影响疗效,或基于这个生物标志物识别进行治疗只会杀死一部分癌细胞,而而不是全部。尽管有这些局限性,基因组图谱仍然是癌症治疗中非常有用的工具。
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