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NIPT新时代——无创单基因遗传病检测

2022-03-01 09:57  基因百科 

在人的生长、发育过程当中,DNA片段的组成起着关键的作用,当外界环境对人体DNA片段造成不可修复的影响时,就会使人体产生疾病,甚至有可能将疾病通过遗传物质遗传给下一代。目前,人类常见遗传病类型可大致分为染色体病、单基因遗传病、多基因遗传病和线粒体疾病。其中单基因遗传病大多属于罕见病,但由于其种类较多,累计总体发生率可达2%-3%。

单基因遗传病的防控

对于单基因遗传病的防控大致可分为三个阶段

1.孕前阶段,可通过遗传咨询或PGT-M来进行防控,但PGT-M,价格高,操作复杂,一般经过PGT-M后,仍需进行产前诊断。

2.产前阶段,对于血清学或超声异常的人群,仍需进行侵入性产前诊断:绒毛取样术、羊膜腔穿刺术、脐静脉穿刺术等,存在约1%的流产风险。

3.新生儿阶段,一般是在新生儿出生后早期预防,进行新生儿遗传病检测。

无创单基因遗传病的检测

随着测序技术的发展,广大科研医护工作者遵循早发现早干预的原则,找到胎儿游离DNA在单基因遗传病早期筛查中的契机,先后有了微列阵、数字PCR、RT-PCR、相对突变剂量法(MRD)、相对单倍体型剂量分析(RHDO)、高通量测序(NIPT-SGD)等方法,用于早期无创单基因病筛查,其中相对单倍体型剂量分析和高通量测序均不依赖于特异突变检测,对新发突变检测表现良好。

相对单倍体型剂量分析是利用SNP位点构建先证者父母的单倍体型,并确定父母的风险单倍体型,再通过对cfDNA测序数据的分析构建胎儿单倍体型,分析胎儿是否携带致病风险基因,整个过程相对复杂,而高通量测序,则是直接对孕妇cfDNA重点基因外显子、内含子、连接区等位置进行靶向捕获高通量测序,可同时检测1~100种疾病,无需父系遗传信息,相对传统检测技术,通量和灵敏度更高。

NIPT-SGD与NIPT的异同

无创单基因遗传病检测(NIPT-SGD)与NIPT均是使用cfDNA进行检测,但两者在检测方法上会有差异。无创单基因病检测区域包含外显子、连接区、重要内含子。目前常用的NIPT和NIPT Plus,都是基于低深度全基因组测序。仅可以用于计算胎儿染色体拷贝数异常。但是要检测到胎儿更小片段的染色体微缺失/微重复,就必须增加测序深度,通常采用靶向富集的方法。


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